Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms