Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PKHD1P08F94 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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