Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGAVP06756 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms