Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLDN9O95484 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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