Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EIF3JO75822 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms