Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKAP2O75563 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms