Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPLO60437 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPLO60437 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPLO60437 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPLO60437 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPLO60437 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms