Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNMO15061 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNMO15061 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNMO15061 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms