Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3AO14802 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3AO14802 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3AO14802 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3AO14802 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms