Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms