Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms