Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms