Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms