Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms