Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms