Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms