Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A4GALTQ9NPC4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A4GALTQ9NPC4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A4GALTQ9NPC4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
A4GALTQ9NPC4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
A4GALTQ9NPC4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
A4GALTQ9NPC4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
A4GALTQ9NPC4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms