Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms