Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRIM4Q9C037 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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