Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms