Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTNAP3Q9BZ76 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms