Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms