Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms