Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KATNB1Q9BVA0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms