Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms