Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms