Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms