Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC7Q96M83 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms