Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SENP8Q96LD8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms