Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms