Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLDN23Q96B33 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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