Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCLNQ969V3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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