Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms