Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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USP9XQ93008 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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