Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG4Q92954 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms