Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF182Q8N6D2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms