Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms