Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HES3Q5TGS1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HES3Q5TGS1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HES3Q5TGS1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms