Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms