Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms