Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FXNQ16595 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms