Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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DDB1Q16531 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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