Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GABRA6Q16445 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms