Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms