Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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