Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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