Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms