Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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