Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R1Q15078 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms