Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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